MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Lactobacillus salivarius UCC118 chromosome

Total Repeats: 37455

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_007929	ATTTAG	2	12	8	19	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	90960991
2	NC_007929	AT	3	6	33	38	50 %	50 %	0 %	0 %	90960991
3	NC_007929	GCTA	2	8	70	77	25 %	25 %	25 %	25 %	90960991
4	NC_007929	CAG	2	6	95	100	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	90960991
5	NC_007929	AT	3	6	111	116	50 %	50 %	0 %	0 %	90960991
6	NC_007929	ATT	2	6	161	166	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	90960991
7	NC_007929	AAG	2	6	206	211	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	90960991
8	NC_007929	A	6	6	221	226	100 %	0 %	0 %	0 %	90960991
9	NC_007929	AGCTA	2	10	237	246	40 %	20 %	20 %	20 %	90960991
10	NC_007929	A	7	7	294	300	100 %	0 %	0 %	0 %	90960991
11	NC_007929	ATA	3	9	317	325	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	90960991
12	NC_007929	TTC	2	6	327	332	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	90960991
13	NC_007929	TGT	2	6	381	386	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	90960991
14	NC_007929	GCA	3	9	412	420	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	90960991
15	NC_007929	GAA	2	6	433	438	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	90960991
16	NC_007929	T	6	6	446	451	0 %	100 %	0 %	0 %	90960991
17	NC_007929	CTT	2	6	462	467	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	90960991
18	NC_007929	CGG	2	6	471	476	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	90960991
19	NC_007929	ACAA	2	8	600	607	75 %	0 %	0 %	25 %	90960991
20	NC_007929	AAG	2	6	614	619	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	90960991
21	NC_007929	TAC	2	6	650	655	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	90960991
22	NC_007929	T	6	6	673	678	0 %	100 %	0 %	0 %	90960991
23	NC_007929	AAG	2	6	698	703	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	90960991
24	NC_007929	ATG	2	6	731	736	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	90960991
25	NC_007929	A	6	6	739	744	100 %	0 %	0 %	0 %	90960991
26	NC_007929	TCA	2	6	757	762	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	90960991
27	NC_007929	CAA	2	6	793	798	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	90960991
28	NC_007929	CTC	2	6	842	847	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	90960991
29	NC_007929	AGGCTG	2	12	884	895	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	90960991
30	NC_007929	AC	3	6	917	922	50 %	0 %	0 %	50 %	90960991
31	NC_007929	TA	3	6	928	933	50 %	50 %	0 %	0 %	90960991
32	NC_007929	TTC	2	6	996	1001	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	90960991
33	NC_007929	CTA	2	6	1022	1027	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	90960991
34	NC_007929	AGC	2	6	1032	1037	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	90960991
35	NC_007929	ACTA	2	8	1080	1087	50 %	25 %	0 %	25 %	90960991
36	NC_007929	TAT	2	6	1117	1122	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	90960991
37	NC_007929	GAAA	2	8	1148	1155	75 %	0 %	25 %	0 %	90960991
38	NC_007929	TGG	2	6	1248	1253	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	90960991
39	NC_007929	ACT	2	6	1315	1320	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	90960991
40	NC_007929	CGAGC	2	10	1345	1354	20 %	0 %	40 %	40 %	90960991
41	NC_007929	CAT	2	6	1554	1559	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	90960992
42	NC_007929	ATC	2	6	1594	1599	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	90960992
43	NC_007929	TTAACT	2	12	1655	1666	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	90960992
44	NC_007929	AT	3	6	1680	1685	50 %	50 %	0 %	0 %	90960992
45	NC_007929	GAT	2	6	1712	1717	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	90960992
46	NC_007929	TGC	2	6	1720	1725	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	90960992
47	NC_007929	AAG	2	6	1740	1745	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	90960992
48	NC_007929	GTT	2	6	1751	1756	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	90960992
49	NC_007929	AACA	2	8	1800	1807	75 %	0 %	0 %	25 %	90960992
50	NC_007929	CAA	2	6	1839	1844	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	90960992
51	NC_007929	CAG	2	6	1857	1862	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	90960992
52	NC_007929	GAA	2	6	1889	1894	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	90960992
53	NC_007929	TTA	2	6	1962	1967	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	90960992
54	NC_007929	TAA	2	6	2031	2036	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	90960992
55	NC_007929	TTGC	2	8	2048	2055	0 %	50 %	25 %	25 %	90960992
56	NC_007929	ATC	2	6	2090	2095	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	90960992
57	NC_007929	ATG	2	6	2124	2129	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	90960992
58	NC_007929	TTA	2	6	2130	2135	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	90960992
59	NC_007929	ATT	2	6	2221	2226	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	90960992
60	NC_007929	CTT	2	6	2241	2246	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	90960992
61	NC_007929	TCAA	2	8	2344	2351	50 %	25 %	0 %	25 %	90960992
62	NC_007929	CTTCT	2	10	2361	2370	0 %	60 %	0 %	40 %	90960992
63	NC_007929	AAT	2	6	2387	2392	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	90960992
64	NC_007929	GAA	3	9	2468	2476	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	90960992
65	NC_007929	AGA	2	6	2620	2625	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	90960992
66	NC_007929	A	8	8	2670	2677	100 %	0 %	0 %	0 %	90960992
67	NC_007929	AGAC	2	8	3110	3117	50 %	0 %	25 %	25 %	90960993
68	NC_007929	TA	3	6	3118	3123	50 %	50 %	0 %	0 %	90960993
69	NC_007929	ATT	2	6	3135	3140	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	90960993
70	NC_007929	TTG	2	6	3146	3151	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	90960993
71	NC_007929	TGG	2	6	3165	3170	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	90960993
72	NC_007929	ATG	2	6	3197	3202	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	90960993
73	NC_007929	ATG	2	6	3289	3294	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	90960993
74	NC_007929	AAT	2	6	3305	3310	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	90960993
75	NC_007929	A	6	6	3398	3403	100 %	0 %	0 %	0 %	90960994
76	NC_007929	TTG	2	6	3423	3428	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	90960994
77	NC_007929	TA	3	6	3434	3439	50 %	50 %	0 %	0 %	90960994
78	NC_007929	A	6	6	3498	3503	100 %	0 %	0 %	0 %	90960994
79	NC_007929	ATTA	2	8	3512	3519	50 %	50 %	0 %	0 %	90960994
80	NC_007929	GAG	2	6	3520	3525	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	90960994
81	NC_007929	TCA	2	6	3530	3535	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	90960994
82	NC_007929	A	6	6	3582	3587	100 %	0 %	0 %	0 %	90960994
83	NC_007929	TTTG	2	8	3650	3657	0 %	75 %	25 %	0 %	90960994
84	NC_007929	TCG	2	6	3698	3703	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	90960994
85	NC_007929	TTTA	2	8	3742	3749	25 %	75 %	0 %	0 %	90960994
86	NC_007929	ACAA	2	8	3809	3816	75 %	0 %	0 %	25 %	90960994
87	NC_007929	A	7	7	3815	3821	100 %	0 %	0 %	0 %	90960994
88	NC_007929	AAT	2	6	3881	3886	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	90960994
89	NC_007929	GT	3	6	4015	4020	0 %	50 %	50 %	0 %	90960994
90	NC_007929	TTGA	2	8	4038	4045	25 %	50 %	25 %	0 %	90960994
91	NC_007929	ATG	2	6	4059	4064	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	90960994
92	NC_007929	ACA	2	6	4086	4091	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	90960994
93	NC_007929	GAT	2	6	4110	4115	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	90960994
94	NC_007929	CAG	2	6	4177	4182	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	90960994
95	NC_007929	TGA	2	6	4213	4218	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	90960994
96	NC_007929	A	6	6	4222	4227	100 %	0 %	0 %	0 %	90960994
97	NC_007929	TGT	2	6	4246	4251	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	90960994
98	NC_007929	GAT	2	6	4254	4259	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	90960994
99	NC_007929	TGAG	2	8	4264	4271	25 %	25 %	50 %	0 %	90960994
100	NC_007929	CAA	2	6	4362	4367	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	90960994
101	NC_007929	TTAA	2	8	4368	4375	50 %	50 %	0 %	0 %	90960994
102	NC_007929	AGA	2	6	4415	4420	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	90960994
103	NC_007929	GAG	2	6	4437	4442	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	90960994
104	NC_007929	GAA	3	9	4457	4465	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	90960995
105	NC_007929	AGAAA	2	10	4466	4475	80 %	0 %	20 %	0 %	90960995
106	NC_007929	AAG	2	6	4482	4487	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	90960995
107	NC_007929	ATG	2	6	4503	4508	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	90960995
108	NC_007929	CAA	2	6	4575	4580	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	90960995
109	NC_007929	CAT	2	6	4595	4600	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	90960995
110	NC_007929	ATT	2	6	4613	4618	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	90960995
111	NC_007929	TGA	2	6	4654	4659	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	90960995
112	NC_007929	GAA	2	6	4676	4681	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	90960995
113	NC_007929	GTC	2	6	4746	4751	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	90960995
114	NC_007929	GGT	2	6	4787	4792	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	90960995
115	NC_007929	TGG	2	6	4822	4827	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	90960995
116	NC_007929	CAA	2	6	4866	4871	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	90960995
117	NC_007929	GAT	2	6	4898	4903	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	90960995
118	NC_007929	TATGG	2	10	4913	4922	20 %	40 %	40 %	0 %	90960995
119	NC_007929	CCAGAT	2	12	5009	5020	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	90960995
120	NC_007929	TGA	2	6	5113	5118	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	90960995
121	NC_007929	AAG	2	6	5127	5132	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	90960995
122	NC_007929	GAA	2	6	5144	5149	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	90960995
123	NC_007929	TGG	2	6	5161	5166	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	90960995
124	NC_007929	CAA	2	6	5314	5319	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	90960995
125	NC_007929	TAAT	2	8	5379	5386	50 %	50 %	0 %	0 %	90960995
126	NC_007929	ATG	2	6	5421	5426	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	90960995
127	NC_007929	GTA	2	6	5468	5473	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	90960995
128	NC_007929	ACAA	2	8	5506	5513	75 %	0 %	0 %	25 %	90960995
129	NC_007929	ATT	2	6	5557	5562	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	90960995
130	NC_007929	GCAAA	2	10	5606	5615	60 %	0 %	20 %	20 %	90960995
131	NC_007929	AAG	2	6	5684	5689	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	90960995
132	NC_007929	ATT	2	6	5761	5766	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	90960995
133	NC_007929	CTG	2	6	5784	5789	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	90960995
134	NC_007929	CAA	2	6	5871	5876	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	90960995
135	NC_007929	TAGA	2	8	5877	5884	50 %	25 %	25 %	0 %	90960995
136	NC_007929	GAA	2	6	5897	5902	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	90960995
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138	NC_007929	GAA	2	6	5942	5947	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	90960995
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